Die große Zahl der Verhafteten bereitete den Sicherheitskräften in den ersten Tagen Probleme. Sie hatten weder einen exakten Überblick über die Anzahl der Häftlinge noch eindeutige Vorgaben für die Vernehmungen.
Die Teilnahme an Demonstrationen oder das Fotografieren reichte in vielen Fällen schon aus, Haftbefehle zu erlassen und später hohe Freiheitsstrafen auszusprechen.
Die Haftanstalten waren wieder überfüllt, obwohl im Zuge des „Neuen Kurses“ immer noch Entlassungen stattfanden. Die Häftlinge, die wegen ihrer Beteiligung am 17. Juni einsaßen, hatten in einigen Zuchthäusern ein „X“ auf ihrer Anstaltskleidung. Aufständische, die bereits nach wenigen Tagen wieder auf freien Fuß kamen, berichteten darüber, dass sie geschlagen worden waren.